Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC174Q6PII3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms