Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms