Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS3Q68E01 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms