Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARMIL1Q5VZK9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL1Q5VZK9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms