Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C10orf55Q5SWW7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms