Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP170Q5SW79 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP170Q5SW79 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms