Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALFQ53S48 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms