Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP13A4Q4VNC1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms