Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNPY1Q3B7I2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPY1Q3B7I2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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