Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms