Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms