Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRNQ16849 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRNQ16849 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms