Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME3Q16798 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME3Q16798 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME3Q16798 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME3Q16798 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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