Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CTF1Q16619 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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