Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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