Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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