Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
USF2Q15853 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
USF2Q15853 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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