Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms