Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP10Q15642 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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