Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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SS18Q15532 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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SS18Q15532 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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SS18Q15532 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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SS18Q15532 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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SS18Q15532 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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SS18Q15532 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SS18Q15532 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SS18Q15532 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SS18Q15532 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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