Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms