Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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