Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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NFIXQ14938 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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NFIXQ14938 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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NFIXQ14938 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFIXQ14938 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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