Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms