Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms