Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAMK2DQ13557 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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