Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PICALMQ13492 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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