Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCIRG1Q13488 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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