Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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PMS2P3Q13401 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PMS2P3Q13401 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PMS2P3Q13401 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PMS2P3Q13401 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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