Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATMQ13315 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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