Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2BQ13224 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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