Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms