Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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