Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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