Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms