Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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KCNMA1Q12791 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNMA1Q12791 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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