Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms