Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBRQ0VD83 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms