Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms