Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms