Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms