Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1DQ01668 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms