Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms