Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms