Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms