Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3AP98173 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3AP98173 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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