Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms