Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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