Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms