Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS29P62273 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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